Buen día, VirtualBox en Fedora 29 ya no necesita añadir el repositorio como indica la página web de virtualbox.org (es el procedimiento seguido), añadiendo el respositorio RPMfusion es suficiente para tener virtualbox, ya no necesita añadir otros paquetes, dnf resuelve todas las dependencias.
$sudo dnf search VirtualBox
$sudo dnf install VirtualBox
Si desea se añade el virtual extension pack, se descarga desde la página web virtualbox.org.
$sudo usermod -a -G vboxusers tu_usuario
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